Да, похоже, что вопрос по отверстию в блоке относится к устройствам для стопорения/фиксирования тележки со снарядом на месте (наверное, в какой-то момент предусматривался тормоз непосредственно на тележке). Наличие помещения ниже, ПМСМ, не имеет никакого отношения к фукционалу отверстий (по чертежу нижнего этажа, там коридор между двумя из 4-х кубриков личного состава, предназначен ли он для л/с не совсем ясно, т.к. нар там не показано).
На чертеже севастопольской батареи что-то я аналогичного отверстия не углядел. Там справа (слева) от линии подачи к башне скорее всего какой-то механизм; а стопорится тележка, наверняка упираясь в стену через какой-то демпфирующий элемент.
Отверстие, насколько можно судить по снимку, сделано во время формирования блока. Если и пробито после отливки, то аккуратно отделано, с применением того же цемента, что на всём блоке (чтоб ответить точнее, надо обратить на это внимание при посещении).